誰料出師不利，動靜還沒鬧出來，消息卻早走漏了，八月十五日起義的消息，在八月十三日就被日本政府知道了。德川幕府連忙派兵捉拿，突襲之下，顏思齊等人倉皇逃走。二十八個弟兄經過浴血奮戰，總算逃出了平戶，乘船來到了日本九州島。

　　由于事發突然，顏思齊和他的弟兄們可以說是殺出一條血路逃出來的。多年來蟄伏日本積累下的財富人馬，這一仗下來死的死散的散，基本全都賠光了。跟隨顏思齊跑出來的，只有十三條傷痕累累的破船，而他們此時停靠的九州島，更不是安全的地方，日本幕府的人馬隨時可能追來，但又能跑到哪里去呢？正當顏思齊走投無路的時候，他的把兄弟陳衷紀建議去臺灣。

　　“隆慶開關”之后的臺灣，雖與大陸往來日益密切，但依然還是荒涼之地。林風遠征菲律賓，幾乎帶走了臺灣島所有的屯墾人丁。這之后的臺灣，在明朝萬歷、天啟年間，也時常有人往來，在17世紀早期，每年來臺灣貿易以及捕魚的船只，大約有近百艘，臺灣北端的基隆，也常有內地漢人來此居住，不過多是一些漁民和商旅，幾乎沒有常住人口。

　　明朝天啟四年，公元1624年八月二十九日，他們抵達臺灣北港，當顏思齊踏上臺灣島的土地時。顏思齊上岸后隨即下令，在臺灣島上修筑房屋，開墾荒地。顏思齊還下令和高山族同胞和平相處，劃定了活動范圍。顏思齊在北港東南的新港，建立了自己的村落。顏思齊又命楊永生回大陸招人，帶來了三千農民。顏思齊的這支墾荒大軍，就這樣在臺灣站住了腳。

　　顏思齊的此番選擇，于他自己而言，是一種養精蓄銳的選擇。但是對于臺灣的發展來說，卻無意中翻開了又一頁：他們是繼林鳳遠走南洋之后，第二批集體開發臺灣島的大陸人，比起第一次開發臺灣的半途而廢，這一次他們不但堅持了下來，并且將臺灣的繁榮，從遙遠的明末，延續到現代文明的今天。

　　就在顏思齊登陸臺灣的同年，明朝天啟四年，公元1624年九月，荷蘭人從臺灣西南岸登陸，相繼修筑了赤坎城和熱蘭遮城，因與顏思齊部為鄰，關系就立刻微妙起來。雙方發生過摩擦：但是很快各自劃定勢力范圍，雙方在海外貿易上也有合作關系。

　　與此同時，顏思齊部也加快了開發臺灣的步伐，他四處派遣船隊，除了拓展貿易外，更不斷的從內地招納農民來臺屯墾，并提供武力保護。到了第二年，臺灣本土屯墾的人口，已經超過了萬人的規模。顏思齊干的另一個主要工作就是打劫，用打劫得到的錢，盡可能的購買武器和戰船。尤其要對付強大的荷蘭人，沒有精良的炮艦是不行的。沒有訓練有素的水軍更不行。

　　明朝天啟五年，公元1625年九月，正值是年臺灣糧食大豐收，興奮的顏思齊拉著弟兄們，進入普羅山中打獵，一路縱酒狂歌，然而快樂之后，就是意外的不幸，歸來后的顏思齊，竟然一病不起，數日后即英年早逝，臨終的時候，面對跟隨他打拼一生的老弟兄們，他嘆息一聲，說出了那個埋藏在他心中許久的理想：“本期創建功業，揚中國聲名。今壯志未遂，中道夭折，公等其繼起。”

　　顏思齊的人生，對于臺灣的歷史而言，仿佛一顆轉瞬即逝的流星，然而他的光芒，卻照亮了整個臺灣島的未來。從那時起，臺灣大規模的移民高潮終于到來了。每年都有大批的百姓跨越海疆，進入臺灣島，在島上屯墾耕種、繁衍生息。他的功業與威名，也因此超越了歷史，被成為“開臺圣王”。

　　顏思齊抱憾地走了，但對于當時這些立足未穩的拓荒者來說，現實卻很嚴峻，荷蘭人還在一邊虎視眈眈。誰又能接過“開臺圣王”的班，繼續他未完成的事業。人選，就是顏思齊二十八位結義兄弟中最小的一位：鄭芝龍。