在校求學期間,孫祁祥“女學霸”潛質逐漸顯露。1979年,孫祁祥考入蘭州大學經濟系,而后以一篇題為《根本出路在于改革國家所有制形式》的論文在經濟學界初露鋒芒。她師從著名經濟學家蕭灼基教授,在北京大學又以“首屆北大研究生學術十佳”身份博士畢業,留校任教。
1993年,北京大學設立保險學專業,她從熟悉的經濟學專業調入保險學這個新專業,赴美學習一年。學成歸來,她拒絕獵頭公司開出的30萬年薪,接下月薪400多元的保險學專業主任一職。
2010年,孫祁祥成為北京大學經濟學院百年歷史上首位女性院長,敢于擔當,勇于創新,成績斐然。
由她任首任主任的北大保險學專業被批準成為國家級“質量工程”的“特色專業”;由她牽頭設立的北京大學中國保險與社會保障研究中心連續三屆蟬聯“北京大學優秀科研中心”稱號;由她撰寫的《保險學》先后成為國家級規劃教材,一版再版,被國內數十所高等院校的保險金融專業選作指定或推薦教材。
她還是國際學術交流中的“熟面孔”。國際保險學會董事會里的唯一一位中國大陸學者,第一位應邀在美國風險與保險學會年會上(1996年)宣讀學術論文的中國大陸學者,第一位作為人物介紹出現在“美國風險與保險學會”會刊上的亞洲人。作為亞太風險與保險學會的前任主席,孫祁祥的學術足跡遍布世界各地,孜孜不倦,做起了中國風險管理與保險學界的對外的探路者和領路人。