根據(jù)《中國（福建）自由貿(mào)易試驗區(qū)總體方案》，福建自貿(mào)區(qū)被賦予六大主要任務，共16項措施?？傮w方案全文大約一萬字，其中第三部分的主要任務和措施的總字數(shù)約8000字。

　　一、轉變政府職能下放權限

　　總體方案提出，將深化行政管理體制改革，加快推進政府管理模式創(chuàng)新，福建省能夠下放的經(jīng)濟社會管理權限，全部下放給自貿(mào)區(qū)。并將原由政府部門承擔的資產(chǎn)評估、鑒定、咨詢、認證、檢驗檢測等職能逐步交由法律、會計、信用、檢驗檢測認證等專業(yè)服務機構承擔。

　　二、兩方面改革投資管理體制

　　A.改革外商投資管理模式。探索對外商投資實行準入前國民待遇加負面清單管理模式，對負面清單之外領域，按照內(nèi)外資一致原則，外商投資項目實行備案制（國務院規(guī)定對國內(nèi)投資項目保留核準的除外），由福建省辦理。

　　實施自貿(mào)區(qū)外商投資負面清單制度，減少和取消對外商投資準入限制。先行選擇航運服務、商貿(mào)服務、專業(yè)服務、文化服務、社會服務及先進制造業(yè)等領域擴大對外開放，積極有效吸引外資。

　　B.對一般境外投資項目和設立企業(yè)實行備案制。

　　三、支持開展汽車平行進口試點

　　A.支持開展汽車平行進口試點。允許在海關特殊監(jiān)管區(qū)內(nèi)設立保稅展示交易平臺。符合條件的地區(qū)可按政策規(guī)定申請實施境外旅客購物離境退稅政策。允許境內(nèi)期貨交易所開展期貨保稅交割試點。推進動漫創(chuàng)意、信息管理、數(shù)據(jù)處理、供應鏈管理、飛機及零部件維修等服務外包業(yè)務發(fā)展。

　　B.提升航運服務功能，允許設立外商獨資國際船舶管理企業(yè)。允許外商以合資、合作形式從事公共國際船舶代理業(yè)務，外方持股比例放寬至51%。允許試點海運快件國際和臺港澳中轉集拼業(yè)務。允許在自貿(mào)區(qū)內(nèi)注冊的大陸資本郵輪企業(yè)所屬的“方便旗”郵輪，經(jīng)批準從事兩岸四地郵輪運輸。

　　C.推進通關機制創(chuàng)新。建設國際貿(mào)易“單一窗口”，全程實施無紙化通關。試行企業(yè)自主報稅、自助通關、自助審放、重點稽核的通關征管作業(yè)。

　　四、金融企業(yè)結匯政策放寬

　　A.擴大金融對外開放。符合條件的自貿(mào)區(qū)內(nèi)機構在限額內(nèi)自主開展直接投資、并購、債務工具、金融類投資等交易。深化外匯管理改革，將直接投資外匯登記下放銀行辦理，外商直接投資項下外匯資本金可意愿結匯，進一步提高對外放款比例。允許自貿(mào)區(qū)內(nèi)企業(yè)、銀行從境外借入本外幣資金，企業(yè)借入的外幣資金可結匯使用。放寬自貿(mào)區(qū)內(nèi)法人金融機構和企業(yè)在境外發(fā)行人民幣和外幣債券的審批和規(guī)模限制。

　　B.拓展金融服務功能。推進利率市場化，允許符合條件的金融機構試點發(fā)行企業(yè)和個人大額可轉讓存單。在加強有效監(jiān)管前提下，允許符合條件的中資銀行試點開辦外幣離岸業(yè)務。支持自貿(mào)區(qū)內(nèi)法人銀行按有關規(guī)定開展資產(chǎn)證券化業(yè)務。在合法合規(guī)、風險可控前提下，逐步開展商品場外衍生品交易。支持廈門兩岸區(qū)域性金融服務中心建設。

　　五、建設平潭國際旅游島

　　建設國際旅游島，研究推動平潭實施部分國家旅游團入境免簽政策，對臺灣居民實施更加便利的入出境制度。